Text
Identifikasi dan Pemodelan Farmakofor 2-Arloxy-3-Phenylpropanoic Acid Yang Selaras Dengan Binding Site Reseptor Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma
Dalam penelitian ini, pengembangan model farmakofor dari dataset ligan agonis untuk reseptor PPAR gamma dilakukan dengan menggunakan modul Catalyst/ ...
-
Code CallNo Lokasi Ketersediaan 01021151000018 Tersedia -
Perpustakaan Fakultas FarmasiJudul Seri -No. Panggil 3091Penerbit Fak. Farmasi Unpad : Sumedang., 2015 Deskripsi Fisik -Bahasa IndonesiaISBN/ISSN -Klasifikasi 3091Tipe Isi -Tipe Media -Tipe Pembawa -Edisi NULLSubyek Info Detil Spesifik -Pernyataan Tanggungjawab NULL -
Dalam penelitian ini, pengembangan model farmakofor dari dataset ligan agonis untuk reseptor PPAR gamma dilakukan dengan menggunakan modul Catalyst/ Hypogen. Training set yang terdiri dari 22 ligan agonist dengan aktivitas diantara 0,1 ke 10.000 nM dipilih. Model farmakofor yang paling prediktif (Hypo1), terdiri dari 5 fitur, yaitu, satu ikatan hidrogen akseptor (HBA), dua hidrofobik (HY), satu negatif terionisasi (NI) dan satu cincin aromatik (RA), memiliki korelasi (r) sebesar 0,9730 dan root mean square deviation sebesar 0,5910. Nilai entropi (configuration cost) Hypo1 adalah 16,4502, yaitu dalam rentang yang diperbolehkan. Perbedaan antara null hypothesis dan fixed cost dan antara null hypothesis dan total cost Hypo1 adalah 45,3437 dan 40,9316 masing-masing. Model ini divalidasi dengan test set yang terdiri dari 25 ligan struktural beragam dan menunjukkan kemampuan bagus dalam memprediksi rentang aktivitas ligan. Pendekatan validasi ini memberikan kepercayaan pada model farmakofor (Hypo1) dikembangkan sebagai farmakofor dalam penapisan maya senyawa penanda untuk diambil sebagai entitas kimia baru agonis PPAR gamma. Model ini juga dapat digunakan untuk memprediksi aktivitas biologis ligan karena biaya yang mahal dan waktu sintesis yang lama. -
Tidak tersedia versi lain
-
Silakan login dahulu untuk melihat atau memberi komentar.